| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
|
Data corrente: |
24/03/2011 |
|
Data da última atualização: |
14/10/2011 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
|
Afiliação: |
RENATA STOLF-MOREIRA, UNESP Jaboticabal; ELIANA GERTRUDES DE MACEDO LEMOS, UNESP Jaboticabal; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; MAGDA APARECIDA BENEVENTI, UFRGS; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA, UEL; SELMA DOS SANTOS PEREIRA, UEL; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO. |
|
Título: |
Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. |
|
Ano de publicação: |
2011 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis. |
|
Palavras-Chave: |
Déficit hídrico; Estabilidade de expressão; Expressão gênica; Expression stability; RT-qPCR. |
|
Thesagro: |
Biotecnologia; Deficiência hídrica; Glycine Max; Soja. |
|
Thesaurus Nal: |
Agricultural biotechnology; Gene expression; Plant-water relations; Soybeans. |
|
Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31023/1/46n01a08.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168638/1/Identification-of-reference-genes-for-expression.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02275naa a2200373 a 4500
001 1882641
005 2011-10-14
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSTOLF-MOREIRA, R.
245 $aIdentification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean.
260 $c2011
520 $aThe objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis.
650 $aAgricultural biotechnology
650 $aGene expression
650 $aPlant-water relations
650 $aSoybeans
650 $aBiotecnologia
650 $aDeficiência hídrica
650 $aGlycine Max
650 $aSoja
653 $aDéficit hídrico
653 $aEstabilidade de expressão
653 $aExpressão gênica
653 $aExpression stability
653 $aRT-qPCR
700 1 $aLEMOS, E. G. de M.
700 1 $aABDELNOOR, R. V.
700 1 $aBENEVENTI, M. A.
700 1 $aROLLA, A. A. P.
700 1 $aPEREIRA, S. dos S.
700 1 $aOLIVEIRA, M. C. N. de
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|   |
| 2. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação de um método de determinação do número de cópias de transgenes no genoma da soja por quantificação relativa por QPCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 100, trab. 168. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 3. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Method validation for quantification of transgene copy number in soybean genome using qPCR relative quantification by 2 -^^ Ct or 2 ^ Ct formule. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 233, ref. P581. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 4. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Expression analysis of transcription factors involved in drought tolerance in soybean roots. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 160.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 5. | | LOPES, V. S.; ROLLA, A. A. P.; LIMA, D. de; DOMIT, L. A.; DALBOSCO, M.; MIRANDA, L. C.; MARCELINO, F. C. Monitoramento da cadeia produtiva da soja: identificação de pontos críticos e nível de contaminação entre cultivos de soja convencional e transgênica resiste a glifosato. In: SIMPÓSIO DE CIÊNCIAS AMBIENTAIS DO NORTE DO PARANÁ, 2., 2009, Bandeirantes. [O Desafio do desenvolvimento sustentável: resumos.]. Bandeirantes: UENP, 2009. 4 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 6. | | GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M. Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis BMC Genomics, v. 15, n. 643, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 8. | | KANAMORI, N.; GIROTTO, L.; SANCHES B. B.; LEITE J. P.; ENGELS, C.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Agrobacterium-mediated transformation of brazilian soybean cultivar, BR 16. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p.105, trab. 177. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 9. | | SALINET, L. H.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M.; MARIN, S. R. R.; ENGELS, C.; OLIVEIRA, R. F. de; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação fisiológica e agronômica de soja geneticamente modificada visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 173. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 10. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; GIROTTO, L.; LEITE J. P.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção e caracterização de plantas de soja (Glycine max) geneticamente modificadas visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 176. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 11. | | LEITE, J. P.; KANAMORI, N.; FUGANTI, R.; GIROTTO, L.; ROLLA, A. A. P.; ENGELS, C.; MARINHO, J. P.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção de plantas de soja geneticamente modificadas via Agrobacterium tumefaciens. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 130-133. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 12. | | LOPES, V. S.; ROLLA, A. A. P.; FILHO, P. J. C.; KUWAHARA, M. K.; PASSIANOTO, A. L. de L.; LIMA, D.; DOMIT, L. A.; DALBOSCO, M.; MIRANDA, L. C.; MARCELINO, F. C. Identificação de pontos críticos de contaminação cruzada entre cultivos transgênicos e convencional na cadeia produtiva da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 105, trab. 178. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 13. | | STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 14. | | ROLLA, A. A. P.; KANAMORI, N.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; ENGLES, C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Molecular characterization of genetically modified soybean lines developed aiming to obtain drought tolerance. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 3., 2011, Ilhéus. [Abstracts...]. [Ribeirão Preto]: SBG, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 15. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; PEREIRA, S. S.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; LOPES, V. S.; YAMAGUCHI -SHINOZAKI, K.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Quantification of transgene copies in soybean genome using quantitative real time PCR through absolute and relative methodologies. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 167.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 16. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética em soja (Glycine max (L)Merril) visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética e Melhoramento - Resumos: Pdf.634.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 17. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R. V.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética de soja com promotor e fator de transcrição estresse induzidos visando tolerancia à seca. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 108-109. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 18. | | PEREIRA, S. S.; GUIMARÃES, F. C. M.; CARVALHO, J. F. C.; STOLF-MOREIRA, R.; OLIVEIRA, M. C. N.; ROLLA, A. A. P.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Transcription factors expressed in soybean roots under drought stress. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 10, n. 4, p. 3689-3701, Oct. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 19. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; KANAMORI, N.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; MARCELINO, F. C.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Transgene copy number quantification by qPCR in GM soybean lines containing the rd29A:AtDREB2A construction. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 197.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| 20. | | ENGELS, C.; FUGANTI, R.; RODRIGUES, F. A.; GIROTTO, L.; SANCHES B. B.; LEITE J. P.; ROLLA, A. A. P.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; SHINOZAKI, K.; NEPOMUCENO, A. L. Obtenção e caracterização de plantas de soja (Glycine max) geneticamente modificadas visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p.104, trab. 176. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
| Registros recuperados : 27 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
